Per preparare i cupcake, preriscalda il forno a 175°C. Rivesti 12 stampini per muffin con pirottini di carta e spruzzali generosamente con spray da cucina.
In una ciotola media, sbatti insieme il cacao in polvere, la farina, il lievito in polvere e il sale. In una ciotola separata, mescola il burro o l'olio di cocco, le uova e la vaniglia. Incorpora lo yogurt greco, mescolando finché non ci sono più grumi grandi. Incorpora lo sciroppo d'acero puro. Alterna l'aggiunta del composto di farina e del latte, iniziando e finendo con il composto di farina, e mescolando solo fino a incorporare. (Per ottenere i migliori risultati, aggiungi il composto di farina in 3 parti uguali).
Dividi l'impasto tra i pirottini di carta preparati. Cuoci a 175°C per 20-22 minuti o finché i centri risultano sodi al tatto e uno stecchino inserito al centro esce pulito. Lascia raffreddare nella teglia per 5 minuti prima di trasferire su una griglia per raffreddare completamente.
Per preparare la glassa, aggiungi il cacao in polvere in una piccola ciotola e crea una fontana al centro. Versa il latte, la vaniglia e la stevia liquida. Mescola fino a completo amalgama. Spalma sulla parte superiore dei cupcake raffreddati.